处长：主持全面工作，分管审计处信息化建设。

副处长：协助处长工作，分管工程审计科，宣城校区审计科，制定分管科室的工作制度

副处长：协助处长工作，分管财务审计科、综合科，制定分管科室的工作制度。

工程审计科：负责执行、起草学校有关工程项目审计制度；负责合肥校区基建工程、修缮工程项目的预算审计、竣工决（结）算审计工作，以及工程立项、合同的审查；负责工程项目受托审计中介机构的过程监督和管理；完成领导交办的其他工作。

财务审计科：负责执行、起草学校领导干部经济责任、科研经费、国有资产管理等方面审计制度；负责经济责任审计、财务收支审计、科研经费审计等其他专项工作；负责财务事项受托审计中介机构的过程监督和管理；负责校级财务银行对账单的审核；完成领导交办的其他工作。

综合审计科：负责处里综合业务、起草有关文件、组织会议及记录等；负责学校预算执行及决算审计、内控审计、专项审计等工作，协调校办企业年度审计工作；负责审计系统的管理；负责中介机构的委托和考核；对外合同的管理；负责审计档案的复核、归档等工作；印章的使用及保管；完成领导交办的其他工作。

宣城校区审计科：负责执行、起草宣城校区有关工程项目审计制度；负责宣城校区基建工程、修缮工程项目的预算审计及竣工决（结）算审计工作，以及工程立项、合同的审查；参与宣城校区工程项目受托审计中介机构的过程监督和管理；完成领导交办的其他工作。